Il Blu Galapagos si trova in Avenida Manuel J. Calle, a Cuenca, città coloniale sulle Ande del sud dell'Ecuador, dichiarata Patrimonio dell'Umanità dall'UNESCO. Il centro storico conserva un'architettura spagnola ben preservata, con chiese, cortili interni e facciate colorate lungo il fiume Tomebamba.
Cuenca è nota anche per la produzione tradizionale del cappello di paglia toquilla, conosciuto all'estero come cappello Panama, un artigianato originario di questa regione delle Ande ecuadoriane.